Toxicogénomique / Toxicogenomics
Développements en
toxicogénomique : comprendre et prédire la toxicité induite par un composé à
partir de données d'expression génétique. Molecular Omics.(2018). Le domaine de la toxicogénomique vise à comprendre et à prédire la toxicité en
utilisant des données « omiques » afin d’étudier les réponses des systèmes aux
traitements par des composés. Ces dernières années, on a assisté à une
augmentation rapide du nombre de données toxicologiques et « omiques »
disponibles, en particulier de données sur l’expression des gènes, ainsi qu’à
l’élaboration de méthodes d’analyses de ces données. Cette revue résume les
progrès récents relatifs à l'analyse des données d'ARN-Seq et de puces à ADN,
examine les bases de données pertinentes et souligne les applications récentes
des données de toxicogénomique utilisées pour comprendre et prédire la toxicité
des composés. À l'avenir, ces méthodes de pointe seront probablement combinées
à de nouvelles technologies, telles que des modèles de corps humain complets,
pour produire une compréhension globale de la toxicité au niveau des systèmes,
réduisant ainsi la nécessité d'une évaluation de la toxicité in vivo sur des
modèles animaux.
Developments in
toxicogenomics: understanding and predicting compound-induced toxicity from
gene expression data. Molecular Omics.(2018). The toxicogenomics field aims to understand and predict toxicity by using
‘omics’ data in order to study systems-level responses to compound treatments.
In recent years there has been a rapid increase in publicly available
toxicological and ‘omics’ data, particularly gene expression data, and a
corresponding development of methods for its analysis. In this review, we
summarize recent progress relating to the analysis of RNA-Seq and microarray
data, review relevant databases, and highlight recent applications of
toxicogenomics data for understanding and predicting compound toxicity. In
the future, these state-of-the-art methods will likely be combined with new
technologies, such as whole human body models, to produce a comprehensive
systems-level understanding of toxicity that reduces the necessity of in vivo
toxicity assessment in animal models.
